● 研流 ResFlow · 使用说明书

研流 使用指南

从一份数据到一份论文素材,这份说明讲清整条流程,以及每一步是用来干什么的。第一次用,照着走一遍即可。

一、它是什么

研流把临床研究中反复要做的统计动作,按「选题 → 分析 → 出论文素材」的真实流程串成一条线。你既可以单独用某个工具,也可以在「项目工作台」里粘一次数据,把建模和评价一次跑完、并自动汇总成论文素材。所有计算都在你本机浏览器完成,数据不上传、不留存

二、两个入口,按需选用

🧭 研流首页(/research

当你「知道要分析,但不确定用哪个工具」时用。提供两种找法:研究流程地图(按研究的六道工序找)和研究类型模板(选你的研究类型,自动按顺序列出该用的工具)。

🧪 项目工作台(/research/project

当你「有一份数据,要建预测模型并评价、出论文素材」时用。粘一次数据,建模 → ROC → 校准 → DCA → 论文素材,一条线走完,不用反复复制粘贴。下面第三节专门讲它。

三、项目工作台操作流程(核心)

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录入项目数据集

👉 用来干什么:把你的数据交给工作台一次,之后所有分析共用这份数据
把整理好的数据粘进输入框:第一行是列名,其后每行一条记录,列与列之间用 Tab 或逗号分隔(可直接从 Excel 选中带表头的区域复制粘贴)。其中结局列要编码为 0/1(如 0=未发生、1=发生)。点「保存数据集到本项目」后,工作台会自动识别每列类型(数值 / 0-1 / 分类)并存到本机浏览器——换设备不会同步,数据也不会上传。
2

一键基线表(Table 1)

👉 用来干什么:生成论文的第一张表:各组基线特征对比
选一个分组列(如治疗组/对照组),点「生成」。工作台会按变量类型自动选统计量与检验:连续变量给均值±标准差、分类变量给例数(%),并算出组间 P 值。需要更完整的呈现(分类各水平、非参数等),点卡片里的链接进入 Table 1 专门工具。
3

预测模型流水线

👉 用来干什么:建一个预测模型,并一次看全它的三种评价
结局列(0/1)和若干数值自变量,点「拟合模型并评价」。工作台会拟合 Logistic 回归给出各因素的 OR 及 95%CI,并算出每个对象的预测概率——这份预测概率会自动喂入下面三个评价,无需再粘数据:

区分度 · ROC:AUC 衡量模型把「发生与不发生」分开的能力,越接近 1 越强。

校准度:Hosmer-Lemeshow 检验 + 校准斜率,衡量预测概率「数值上准不准」(注意 H-L 的 P>0.05 才说明校准可接受)。

临床实用性 · DCA:决策曲线的净获益,衡量「按这个模型决策到底划不划算」。

区分度和校准度是两回事:AUC 高不代表概率准,两者都要看,再加 DCA 看临床价值,才算评价完整。
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论文素材一键汇总

👉 用来干什么:把上面的结果直接变成可投稿的方法与结果草稿
这一步在拟合出模型后才会出现(没有结果就没法生成结果文字)。它会自动写出可编辑的「统计方法」「结果」两段草稿(数值取自你当前的分析),配一份 TRIPOD 报告清单(预测模型研究的报告规范,逐条勾选自查),并支持复制全文导出 Word(.doc)(含基线表、方法、结果、回归表)。草稿是起草辅助,投稿前请逐个核对数字、补充研究设计细节。

四、研究流程地图:六道工序

研流首页 的「研究流程地图」里,工具按研究的先后顺序分成六组,方便你看清每一步该做什么:
① 设计立项(选统计方法、算样本量)→ ② 数据与基线(基线表、参考区间)→ ③ 统计分析(组间比较、相关与回归、生存分析)→ ④ 诊断与预测模型(诊断效能、ROC、校准、DCA、列线图)→ ⑤ 信度与一致性(ICC、Kappa、Cronbach、方法学比对)→ ⑥ 证据综合(Meta、漏斗图)。

五、研究类型模板:选对你的研究

不确定流程时,在「研究类型模板」里选你的研究类型,工作台会按顺序排好该用的工具:
诊断试验研究、预后/预测模型研究、横断面研究、病例对照研究、队列/生存研究、量表开发与验证、测量一致性/方法学研究、Meta 分析/系统评价。例如选「预后/预测模型研究」,它就按 设计 → 基线 → 建模 → 区分度 → 校准与临床价值 → 展示 一步步给你工具。

六、常见问题

Q:我的数据会上传吗?
默认不会——所有计算在你本机浏览器完成,项目数据存在本机(localStorage)。仅当你登录医生账号并主动点「保存到账号 / 另存为新项目」时,才会把该项目(数据与分析设置)存到你的账号,用于多项目管理与换设备续作;不登录则全程本地。

Q:第④步论文素材为什么没看到?
它只在第③步成功拟合出模型后才出现。请先确认 ROC/校准/DCA 结果已显示,再往下滚动。

Q:自动生成的方法/结果能直接用吗?
作为草稿起草用。数值取自建模数据(属内部表现,偏乐观),投稿前请核对每个数字、补全研究设计细节,并尽量做外部验证。

Q:需要更完整的图和选项怎么办?
每个结果卡片都有进入对应专门工具的链接(如完整 ROC、完整校准曲线、完整决策曲线),可在那里获得更丰富的图表与参数。

七、验证与复核(外部验证闭环)

工具的每个统计引擎都做过校验,多数采用「退化为已知方法」的思路——在特例下,新算法应当精确等于一个公认正确的简单算法。例如:

· Logistic / Cox 回归:与经典数据集(如 Cox 用 Freireich 白血病数据)和标准实现核对系数;
· Fine-Gray 竞争风险:无竞争事件时退化为普通 Cox、无删失时退化为变换数据上的 Cox,多角度一致;
· 限制性立方样条 RCS:基函数在两端外侧严格线性(样条的定义性质),参照点处效应=1;
· 时间依赖 AUC:无删失时精确等于经验 AUC;
· VIF:等于 1/(1−R²),完全共线时为无穷;PH 检验:Schoenfeld 残差在最大似然解处求和≈0(得分为零的性质)。

即便如此,内部表现仍偏乐观,关键结论建议你独立复核。工作台已把这一步做成闭环——R 复核三步法

① 在第④步点「导出 R 代码」,复制按你当前模型与变量生成的脚本(RCS 工具内也有对应 rms 代码);
② 在 R 里跑(脚本已含 glm/coxph、pROC、tableone、car::vif、cox.zph 等);
③ 按代码下方的「R 复核对照」清单,把 R 的 OR/HR、AUC、C-index、PH、VIF 等与本工具逐项对上。方向与量级一致即说明实现吻合。

真正的外部验证还应包括在独立人群/数据上重新评估模型(而非仅复核同一份数据的计算);预测模型研究建议遵循 TRIPOD 报告规范。

开始使用

准备好数据就去 项目工作台 走一遍;想先按工具浏览,去 研流首页Labs 总站